Tlenoterapia hiperbaryczna jest procesem bardzo ubogim w ryzyko powikłań. Istnieje jednak kilka przeciwwskazań do zabiegu, o których warto pamiętać:

• nieleczona odma,
• ostre schorzenia uszu,
• padaczka,
• stosowanie niektórych leków, głównie cytostatyków (Doksorubicyna, Bleomycyna, Cisplatinum); inne leki: Mafenide acetale,
• ciąża,
• zapalenie nerwu wzrokowego,
• rozrusznik serca,
• choroby płuc (np. rozedma) z retencją dwutlenku węgla,
• stany gorączkowe,
• infekcje wirusowe,
• przebyte operacje ucha oraz klatki piersiowej,
• rozsiana choroba nowotworową,
• zapalenie zatok nosowych,
• stan podgorączkowy,
• zaćma,
• wrodzona sferocytoza.